При одновременном применении общей системы налогообложения и патента индивидуальному предпринимателю необходимо отдельно определять доходы, относящиеся к каждому режиму. Минфин России разъяснил, что выручка от деятельности, переведенной на ПСН, не учитывается при определении предельного дохода для получения или сохранения освобождения от НДС.
Право на освобождение сохраняется при соблюдении установленного Налоговым кодексом ограничения по выручке. Для его проверки необходимо определить совокупный доход за любые три последовательных календарных месяца. Если сумма поступлений, учитываемых для целей статьи 145 НК РФ, превышает 2 млн рублей без учета НДС, освобождение утрачивается с первого дня месяца, в котором возникло превышение.
Особых правил расчета этого показателя для предпринимателей, использующих одновременно несколько налоговых режимов, статья 145 НК РФ не устанавливает. В связи с этим финансовое ведомство предлагает исходить из характера соответствующих операций. В расчет берутся доходы от реализации, облагаемой НДС, тогда как поступления по операциям, не являющимся объектом налогообложения этим налогом, при определении лимита не учитываются. Аналогичный подход ранее отражался в судебной практике, в частности в постановлении Пленума ВАС РФ от 30.05.2014 No 33.
При работе по патентной системе предприниматель, за исключением предусмотренных законодательством случаев, не имеет статуса плательщика НДС. Поэтому выручка от реализации в рамках патентной деятельности не относится к облагаемым НДС операциям и не увеличивает показатель, используемый для проверки установленного лимита.
Таким образом, предпринимателю, совмещающему ОСН и ПСН, при контроле права на освобождение от НДС необходимо учитывать только выручку, связанную с операциями на общей системе. Доходы от деятельности, переведенной на патент, в расчет двухмиллионного ограничения не включаются.